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TECHNICAL ARTICLES轉(zhuǎn)染可謂是做生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的大家經(jīng)常會(huì)考慮的一項(xiàng)實(shí)驗(yàn)技術(shù),大致原理也都是明白的。但是在實(shí)驗(yàn)時(shí)經(jīng)常會(huì)遇到轉(zhuǎn)染效率太低,以至于無法進(jìn)行后續(xù)的實(shí)驗(yàn)。
到底轉(zhuǎn)染是什么呢?
為什么轉(zhuǎn)染效率不高呢?
其實(shí)
轉(zhuǎn)染,就是在真核細(xì)胞里導(dǎo)入具有生物功能的核酸,并在細(xì)胞中維持其生物功能。
轉(zhuǎn)染方法的選擇
我們熟知且常用的轉(zhuǎn)染方法主要有物理介導(dǎo),化學(xué)介導(dǎo),生物介導(dǎo)。
物理介導(dǎo)方法:電穿孔法、顯微注射和基因槍;
化學(xué)介導(dǎo)方法:如經(jīng)典的磷酸鈣共沉淀法、脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染方法、和多種陽離子物質(zhì)介導(dǎo)的技術(shù);
生物介導(dǎo)方法:有較為原始的原生質(zhì)體轉(zhuǎn)染,和現(xiàn)在比較多見的各種病毒介導(dǎo)的轉(zhuǎn)染技術(shù)。
但實(shí)驗(yàn)室使用較多的主要有化學(xué)介導(dǎo)中的脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染(質(zhì)粒轉(zhuǎn)染)和生物介導(dǎo)中的慢病毒轉(zhuǎn)染法。其中質(zhì)粒轉(zhuǎn)染操作簡單,一般瞬時(shí)轉(zhuǎn)染選擇較多,但有些細(xì)胞系不容易轉(zhuǎn)染,因此選擇轉(zhuǎn)染方式時(shí)一定要做足功課,親身經(jīng)歷告訴我,千萬不要圖方便,否則轉(zhuǎn)染效率簡直崩潰。特別是養(yǎng)原代細(xì)胞的小伙伴,一點(diǎn)要認(rèn)真選擇!病毒轉(zhuǎn)染一般具有能夠穩(wěn)定表達(dá)的優(yōu)勢(shì),且其對(duì)原代細(xì)胞有較高的轉(zhuǎn)染效率,其中更分為慢病毒轉(zhuǎn)染,逆轉(zhuǎn)錄病毒轉(zhuǎn)染和腺病毒轉(zhuǎn)染,其中腺病毒轉(zhuǎn)染可適合更為難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,例如懸浮細(xì)胞、T細(xì)胞、raw細(xì)胞等難轉(zhuǎn)染細(xì)胞。
轉(zhuǎn)染的注意事項(xiàng)
01
有血清時(shí)的轉(zhuǎn)染
血清一度曾被認(rèn)為會(huì)降低轉(zhuǎn)染效率,但只要在DNA-陽離子脂質(zhì)體復(fù)合物形成時(shí)不含血清,在轉(zhuǎn)染過程中是可以使用血清的。
轉(zhuǎn)染過程在兩步中需要使用培養(yǎng)基做為稀釋液:在DNA-陽離子脂質(zhì)體復(fù)合物準(zhǔn)備過程以及復(fù)合物同細(xì)胞接觸過程。
在開始準(zhǔn)備DNA和陽離子脂質(zhì)體試劑稀釋液時(shí)要使用無血清的培養(yǎng)基,因?yàn)檠鍟?huì)影響復(fù)合物的形成。但在復(fù)合物形成后,在加入細(xì)胞中前可以加入血清。
陽離子脂質(zhì)體和DNA的最佳量在使用血清時(shí)會(huì)有所不同,因此如果你想在轉(zhuǎn)染培養(yǎng)基中加入血清需要對(duì)條件進(jìn)行優(yōu)化。
大部分細(xì)胞可以在無血清培養(yǎng)基中幾個(gè)小時(shí)內(nèi)保持健康。對(duì)于對(duì)血清缺乏比較敏感的細(xì)胞,可以使用一些營養(yǎng)豐富的無血清培養(yǎng)基,或者在轉(zhuǎn)染培養(yǎng)基中使用血清。
對(duì)于對(duì)血清缺乏比較敏感的貼壁細(xì)胞,建議使用LIPOFECTAMINE 2000。
02
培養(yǎng)基中的抗生素
抗生素,比如青霉素和鏈霉素,是影響轉(zhuǎn)染的培養(yǎng)基添加物。
這些抗生素一般對(duì)于真核細(xì)胞無毒,但陽離子脂質(zhì)體試劑增加了細(xì)胞的通透性,使抗生素可以進(jìn)入細(xì)胞。這降低了細(xì)胞的活性,導(dǎo)致轉(zhuǎn)染效率低。所以,在轉(zhuǎn)染培養(yǎng)基中不能使用抗生素,甚至在準(zhǔn)備轉(zhuǎn)染前進(jìn)行細(xì)胞鋪板時(shí)也要避免使用抗生素。這樣,在轉(zhuǎn)染前也不必潤洗細(xì)胞。
對(duì)于穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,不要在選擇性培養(yǎng)基中使用青霉素和鏈霉素,因?yàn)檫@些抗生素是GENETICIN選擇性抗生素的競爭性抑制劑。另外,為了保證無血清培養(yǎng)基中細(xì)胞的健康生長,使用比含血清培養(yǎng)基更少的抗生素量。
大多數(shù)已建立的細(xì)胞系都是非整倍體,原代培養(yǎng)包括了表達(dá)不同基因組合的細(xì)胞的混合物。細(xì)胞培養(yǎng)在實(shí)驗(yàn)室中保存數(shù)月和數(shù)年后會(huì)經(jīng)歷突變,總?cè)旧w重組或基因調(diào)控變化等而演化,這會(huì)導(dǎo)致和轉(zhuǎn)染相關(guān)的細(xì)胞行為的變化。如果隨時(shí)間發(fā)現(xiàn)這種變化,融化一管新鮮的細(xì)胞可能會(huì)恢復(fù)原先的轉(zhuǎn)染活性。比如,新鮮融化的NIH 3T3細(xì)胞比傳代8次的細(xì)胞表現(xiàn)出更高的轉(zhuǎn)染效率,融化細(xì)胞的進(jìn)一步傳代并沒有降低轉(zhuǎn)染效率。因此,如果觀察到轉(zhuǎn)染效率降低,可以試著轉(zhuǎn)染新鮮培養(yǎng)的細(xì)胞以恢復(fù)最佳結(jié)果。
03
細(xì)胞狀態(tài)
細(xì)胞的生長狀態(tài)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果,原代細(xì)胞和傳代次數(shù)多的細(xì)胞都不是*,處于對(duì)數(shù)生長期的細(xì)胞生長狀態(tài)最好,zui適合轉(zhuǎn)染。
同時(shí),我們都知道細(xì)胞的密度不宜過大,大家往往注意的都是轉(zhuǎn)染前的密度,失敗過很多次的經(jīng)歷告訴大家,轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞密度更加重要。
有時(shí)候轉(zhuǎn)染時(shí)間太久,等到進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)時(shí)細(xì)胞已經(jīng)肆意生長,漂起來了,豈不前功盡棄,流著眼淚也要告訴大家,考慮好細(xì)胞的生長周期和轉(zhuǎn)染的時(shí)間進(jìn)行鋪板,建議選擇50%~80%區(qū)間密度進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染。
04
細(xì)胞鋪板密度
用于轉(zhuǎn)染的最佳細(xì)胞密度根據(jù)不同的細(xì)胞類型或應(yīng)用而異。
一般轉(zhuǎn)染時(shí),貼壁細(xì)胞密度為70%-90%,懸浮細(xì)胞密度為2×106-4×106細(xì)胞/ml時(shí)效果較好。確保轉(zhuǎn)染時(shí)細(xì)胞沒有長滿或處于靜止期。因?yàn)檗D(zhuǎn)染效率對(duì)細(xì)胞密度很敏感,所以在不同實(shí)驗(yàn)間保持一個(gè)基本的傳代步驟很重要。
鋪板細(xì)胞數(shù)目的增加可以增加轉(zhuǎn)染活性和細(xì)胞產(chǎn)量。在三種不同密度進(jìn)行細(xì)胞鋪板的比較表明鋪板密度最高的,CAT活性也最高。得到最高活性所需的LIPOFECTAMINE試劑的量也相應(yīng)增加了。這些結(jié)果說明,對(duì)于轉(zhuǎn)染相同量的DNA所需的最佳陽離子脂質(zhì)體試劑的量會(huì)因細(xì)胞密度而異。
05
啟動(dòng)子的選擇
獲得高轉(zhuǎn)染活性所需選擇的啟動(dòng)子依賴于選用的細(xì)胞系和要表達(dá)的蛋白。
CMV啟動(dòng)子在大多數(shù)細(xì)胞類型中可以獲得高表達(dá)活性,同其他啟動(dòng)子,如SV40和RSV(勞斯肉瘤病毒)相比,在BHK-21中其活性最高。
這三種病毒啟動(dòng)子在T細(xì)胞來源的細(xì)胞系,如Jurkat中組成表達(dá)水平較低。轉(zhuǎn)染后在培養(yǎng)基中加入PHA-L和PMA可以激活Jurkat細(xì)胞中CMV啟動(dòng)子,而單PMA就足以激活KG1和K562(人骨髓瘤白細(xì)胞)中的CMV啟動(dòng)子。
SV40啟動(dòng)子的表達(dá)在含有大T抗原(存在于COS-1和COS-7)時(shí)會(huì)提高,因?yàn)榇骉抗原可以刺激染色體外的合成。
06
DNA量
高質(zhì)量的DNA對(duì)于進(jìn)行高效的轉(zhuǎn)染至關(guān)重要。以前研究者使用CsCl梯度離心得到的DNA進(jìn)行轉(zhuǎn)染,但是這種方法費(fèi)時(shí)費(fèi)力。
其他的質(zhì)粒純化技術(shù)如Marligen的High Purity Plasmid Purification System使用*的陰離子交換樹脂純化DNA,可以得到用于轉(zhuǎn)染的高質(zhì)量DNA。
另外,Marligen的純化系統(tǒng)實(shí)驗(yàn)步驟很簡單,可以在2小時(shí)內(nèi)完成。
07
瞬時(shí)和穩(wěn)定表達(dá)
DNA轉(zhuǎn)染后,轉(zhuǎn)入基因的表達(dá)可以在1-4天內(nèi)檢測到。僅有一部分轉(zhuǎn)入細(xì)胞的DNA被轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞核內(nèi)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄并最終輸出mRNA到細(xì)胞質(zhì)進(jìn)行蛋白合成。幾天內(nèi),大部分外源DNA會(huì)被核酸酶降解或隨細(xì)胞分裂而稀釋;一周后就檢測不到其存在了。
瞬時(shí)表達(dá)分析檢測未重組質(zhì)粒DNA上基因的表達(dá)。因此,表達(dá)水平與位臵無關(guān),不會(huì)受到周圍染色體元件的影響。瞬時(shí)表達(dá)分析所需的人力和時(shí)間比穩(wěn)定表達(dá)少,但因?yàn)镈NA攝入效率和表達(dá)水平在不同實(shí)驗(yàn)中差異較大,實(shí)驗(yàn)必須很小心。
為了進(jìn)行穩(wěn)定表達(dá),轉(zhuǎn)入的基因必須能和細(xì)胞同步復(fù)制。在轉(zhuǎn)染的質(zhì)粒自發(fā)整合到宿主基因組上時(shí)就會(huì)如此。在一小部分轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中,加入的DNA通過重組整合到基因組上。包含整合DNA的細(xì)胞很少,必須通過對(duì)藥物的抗性篩選進(jìn)行擴(kuò)增或通過表型變化進(jìn)行鑒定。
穩(wěn)定基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)需要數(shù)周,如果需要驗(yàn)證蛋白產(chǎn)量,所需的時(shí)間更長,但得到的細(xì)胞系可以做為蛋白生產(chǎn)的穩(wěn)定來源或用于得到轉(zhuǎn)基因動(dòng)物。
08
瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和轉(zhuǎn)染效率的監(jiān)測
基因的瞬時(shí)表達(dá)在24-72小時(shí)內(nèi)就結(jié)束了。這種快速的瞬時(shí)表達(dá)非常適用于驗(yàn)證質(zhì)粒表達(dá)和監(jiān)測轉(zhuǎn)染步驟的效率。
可以使用報(bào)告基因來確定優(yōu)化條件,其表達(dá)蛋白易檢測,在目的細(xì)胞中不含此蛋白或水平很低。常用的報(bào)告基因包括氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶(CAT),綠色熒光蛋白(GFP),熒光素酶(Lux或Luc)以及b- 半乳糖苷酶(b-gal)??梢允褂煤唵蔚姆峭凰胤椒z測b-gal的表達(dá)以測定轉(zhuǎn)染效率和活性。pCMV SPORT- bgal質(zhì)粒包含CMV啟動(dòng)子調(diào)控下的LacZ基因,轉(zhuǎn)染入真核細(xì)胞內(nèi)后可以直接表達(dá)bgal。結(jié)合簡單的檢測步驟,可以做為監(jiān)測轉(zhuǎn)染條件的一種方便靈敏的方法。
09
穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞系的篩選
連同帶有藥物抗性的篩選標(biāo)記基因一起轉(zhuǎn)染目的基因是建立穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞系z(mì)ui常用的方法。氨基糖苷磷酸轉(zhuǎn)移酶基因(APH或neor)可以合成APH酶,通過磷酸化使藥物失活,從而提供對(duì)GENETCIN選擇性抗生素(G418 Sulfate)的抗性??股乜剐曰蚩梢耘c目的基因在同一個(gè)質(zhì)粒上,也可以在不同的質(zhì)粒上。如果兩個(gè)不同的質(zhì)粒同時(shí)轉(zhuǎn)染,兩個(gè)質(zhì)粒都可能整合形成穩(wěn)定轉(zhuǎn)化子。對(duì)于兩種不同質(zhì)粒的共轉(zhuǎn)染,帶有目的基因的質(zhì)粒和帶有篩選標(biāo)記的質(zhì)粒間的比例為3:1或更高以保證抗性克隆帶有轉(zhuǎn)染的目的基因。
陽離子脂質(zhì)體試劑提供了一種建立穩(wěn)定轉(zhuǎn)染株的高效方法。瞬時(shí)轉(zhuǎn)染效率的改進(jìn)一般也會(huì)提高穩(wěn)定轉(zhuǎn)染效率。比如,使用LIPOFECTAMINE PLUS試劑得到的NIH 3T3細(xì)胞GENETICIN抗生素抗性克隆的數(shù)目比單獨(dú)使用LIPOFECTAMINE增加了大約3倍。要進(jìn)行穩(wěn)定的表達(dá)分析,在轉(zhuǎn)染后次培養(yǎng)細(xì)胞,低密度鋪板,給予生長空間,在幾天或數(shù)周內(nèi)保持篩選壓力。
生長的細(xì)胞比不分裂的細(xì)胞更快的受到GENETICIN抗生素的影響。轉(zhuǎn)染后,在開始篩選前等待48-72小時(shí),使細(xì)胞表達(dá)足夠量的抗性酶,保證在開始篩選時(shí)可以自我保護(hù)。轉(zhuǎn)染后48-72小時(shí)倒掉培養(yǎng)基,加入含有GENETICIN抗生素的培養(yǎng)基,抗生素的濃度根據(jù)劑量反應(yīng)曲線確定,足夠殺死未轉(zhuǎn)染細(xì)胞。因?yàn)樵S多因子影響到篩選所需的GENETICIN抗生素的最佳濃度,包括細(xì)胞類型,培養(yǎng)基和血清濃度等,所以有必要對(duì)每種細(xì)胞作一個(gè)劑量反應(yīng)曲線,確定最佳濃度。
篩選最多可能需要一周時(shí)間,因?yàn)樵谥滤绖┝康腉ENETICIN抗生素存在條件下,細(xì)胞會(huì)分裂1-2次。在次培養(yǎng)細(xì)胞時(shí)使用較低劑量的抗生素,一般是篩選劑量的一半。篩選后的細(xì)胞一般是離散的克隆,根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟煌?,可以分別純化(克?。?,收集進(jìn)行大量培養(yǎng)或染色并進(jìn)行抗性克隆的計(jì)數(shù)。
10
蛋白表達(dá)和培養(yǎng)基的選擇
哺乳動(dòng)物細(xì)胞系合成可溶的,翻譯后修飾的蛋白,比細(xì)菌,真菌或昆蟲細(xì)胞中表達(dá)的蛋白更有可能有生物活性。
穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的細(xì)胞可以合成大量的重組蛋白,而瞬時(shí)轉(zhuǎn)染細(xì)胞可以快速表達(dá),迅速地合成小量蛋白。常用的細(xì)胞系包括CHO,293和COS-7。Invitrogen提供克隆的293-F,293-H,COS-7和CHO-S細(xì)胞,來源于經(jīng)篩選轉(zhuǎn)染效率更高的亞細(xì)胞系。這些細(xì)胞也可用于無血清和限定化學(xué)成分培養(yǎng)基。重組蛋白的大規(guī)模生產(chǎn)一般在穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的懸浮細(xì)胞中進(jìn)行。這些細(xì)胞易于生長到高密度并合成更多蛋白,使用基質(zhì)珠做為固相支持可以使貼壁細(xì)胞懸浮生長。
用于蛋白生產(chǎn)的細(xì)胞的轉(zhuǎn)染可以在添加有血清或無血清培養(yǎng)基中進(jìn)行。但更傾向于使用無血清培養(yǎng)基表達(dá)蛋白,因?yàn)檠宓鞍讜?huì)干擾下游表達(dá)蛋白的純化。無血清培養(yǎng)基一般針對(duì)某一特定細(xì)胞類型優(yōu)化并有幾類無血清培養(yǎng)基不需要添加血清,一般含有不均一的或大量的蛋白(但比添加血清的培養(yǎng)基低得多)。
無蛋白培養(yǎng)基不含蛋白但可能含有不明成分的抽提物,限定化學(xué)成分的培養(yǎng)基不含有蛋白或未知組成的成分。多種多樣的配方使您可以選擇zuishihe您應(yīng)用的一種。
在含血清時(shí)轉(zhuǎn)染的細(xì)胞可以適應(yīng)無血清培養(yǎng)基,無蛋白培養(yǎng)基或限定化學(xué)成分的培養(yǎng)基。在部分情況下(如293-F,293-H,COS-7和CHO-S),對(duì)于已適應(yīng)無血清或無蛋白培養(yǎng)基的細(xì)胞,可以使用其培養(yǎng)基進(jìn)行轉(zhuǎn)染。其他一些無血清培養(yǎng)基包含抑制陰離子脂質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)染的成分,在這些情況下,有必要在諸如D-MEM或OPTI-MEMⅠ等培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng)和轉(zhuǎn)染。
11
轉(zhuǎn)染效率的驗(yàn)證
1、較有效的驗(yàn)證方式必須是qPCR驗(yàn)證;
2、熒光觀察,使用病毒轉(zhuǎn)染,明白自己病毒的情況,是熒光標(biāo)記(一般是GFP)還是非熒光標(biāo)記。質(zhì)粒轉(zhuǎn)染,可以在載體上添加熒光標(biāo)記,幫助自己通過熒光觀察轉(zhuǎn)染效率。但是熒光并不能*證明轉(zhuǎn)染效率,還是通過核酸驗(yàn)證最為準(zhǔn)確。
作者:CellMax
來源:知乎
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