技術(shù)文章
TECHNICAL ARTICLES目前已經(jīng)獲批的10余款甲基化檢測(cè)產(chǎn)品基本都是使用熒光PCR進(jìn)行檢測(cè),采用數(shù)字PCR的這是第一款,從數(shù)字PCR的高靈敏的優(yōu)勢(shì)來(lái)看,這也意味著其檢測(cè)的樣本類型會(huì)更加的普適、易獲得。
從公開信息得知,這款產(chǎn)品的預(yù)期用途為:用于體外定性檢測(cè)人血清中游離DNA(cfDNA)中的BMPR1A和PLAC8基因甲基化水平。
肝癌篩查方法
目前肝癌篩查方式主要包括血液學(xué)AFP(甲胎蛋白)檢測(cè)和影像學(xué)檢查。從目前診療路徑來(lái)看,肝癌早篩通常聯(lián)合AFP和肝臟超聲(US)對(duì)肝癌高危人群進(jìn)行定期篩查,發(fā)現(xiàn)異常再進(jìn)一步考慮CT或者核磁共振檢查。
· 甲胎蛋白(AFP)是目前診斷肝癌應(yīng)用最多的血清學(xué)標(biāo)志物,但仍有近40%肝癌患者AFP持續(xù)在正?;蜉^低水平,而且妊娠、活動(dòng)性肝炎、生殖系統(tǒng)腫瘤、胃腸胰腺等其他消化道腫瘤等人群血清AFP也會(huì)升高。
· 雖然超聲(US)設(shè)備簡(jiǎn)單,價(jià)格低容易開展,在臨床上廣泛應(yīng)用,但其對(duì)早期肝癌診斷靈敏度僅47%,且受肝硬化結(jié)節(jié)干擾,對(duì)操作者經(jīng)驗(yàn)要求較高。即使聯(lián)合應(yīng)用AFP和超聲檢測(cè),對(duì)早期肝癌的靈敏度也僅有63%,仍然無(wú)法滿足早期肝癌篩查的需求。
· CT平掃對(duì)于極早期肝癌(<1 cm)或密度近似正常肝實(shí)質(zhì)的肝癌難以顯示,且具有一定的放射性。
· MRI雖然性能較超聲(US)和CT較大提升,但檢測(cè)的靈敏度和特異性也存在一定的天花板。我國(guó)人口基數(shù)大、經(jīng)濟(jì)水平不足,將其作為常規(guī)篩查手段也不大現(xiàn)實(shí)。
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指南共識(shí)
當(dāng)前,我國(guó)已有多部指南/共識(shí)將基因甲基化推薦用于肝癌早期篩查和診斷。其中,國(guó)家癌癥中心赫捷院士和陳萬(wàn)青教授最新發(fā)表的《中國(guó)人群肝癌篩查指南(2022,北京)》認(rèn)為,體循環(huán)中新型標(biāo)志物的液體活檢手段與血清AFP比較也體現(xiàn)出更高的靈敏度和特異度,包括微小核糖核酸和循環(huán)腫瘤DNA等。這些證明有良好篩查價(jià)值的血清或ctDNA可作為補(bǔ)充篩查技術(shù),但尚不能完替代血清AFP檢測(cè)。2021年由王紅陽(yáng)院士牽頭撰寫的《中國(guó)肝癌早篩策略專家共識(shí)》明確指出cfDNA表觀遺傳性修飾檢測(cè)有一定的應(yīng)用潛力,可以作為個(gè)體化診斷的補(bǔ)充。同年,由中華醫(yī)學(xué)會(huì)肝病學(xué)分會(huì)發(fā)布的《原發(fā)性肝癌二級(jí)預(yù)防共識(shí)》中提到,有多種處于探索階段的新型血清學(xué)分子標(biāo)志物,其中包括循環(huán)腫瘤DNA甲基化等,在診斷肝細(xì)胞癌上有其特定的優(yōu)勢(shì)。
數(shù)字PCR+甲基化
DNA甲基化的改變多發(fā)生于癌癥早期,在某些特定癌癥中,檢測(cè)特異的甲基化標(biāo)志物有助于癌癥的早期發(fā)現(xiàn),進(jìn)而大大提高癌癥患者的生存率。
微液滴數(shù)字PCR (ddPCR)是近年來(lái)PCR技術(shù)的一項(xiàng)新進(jìn)展,通過(guò)微液滴化,終點(diǎn)PCR和泊松分布,數(shù)字PCR無(wú)需標(biāo)準(zhǔn)曲線即可實(shí)現(xiàn)核酸濃度的絕對(duì)定量。與實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)(qPCR)對(duì)比,數(shù)字PCR具有靈敏度高,準(zhǔn)確度高、精密度高、重復(fù)性高,對(duì)PCR抑制劑耐受度高的優(yōu)勢(shì)。
使用ddPCR方法進(jìn)行DNA甲基化分析時(shí),其優(yōu)勢(shì)能夠得到進(jìn)一步的發(fā)揮,在檢測(cè)血漿游離DNA、FFPE DNA等多種樣本來(lái)源的DNA的甲基化狀態(tài)時(shí)表現(xiàn)優(yōu)異。因此,基于ddPCR的甲基化檢測(cè)技術(shù)將來(lái)有潛力應(yīng)用于腫瘤甲基化標(biāo)志物的檢測(cè)中,輔助臨床診斷和治療,應(yīng)用于腫瘤早診和篩查領(lǐng)域。
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