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TECHNICAL ARTICLES蛋白標(biāo)記定量技術(shù)——艾柏森生物
蛋白質(zhì)標(biāo)記定量技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的重要組成部分,它允許科學(xué)家們對蛋白質(zhì)的表達(dá)水平進(jìn)行精確的測量和比較。這些技術(shù)在生物醫(yī)學(xué)研究、藥物開發(fā)、疾病診斷等領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用。以下是一些主要的蛋白質(zhì)標(biāo)記定量技術(shù):
iTRAQ (Isobaric Tag for Relative and Absolute Quantitation):這是一種體外標(biāo)記技術(shù),通過使用不同的同位素標(biāo)簽對樣品中的肽段進(jìn)行標(biāo)記,然后通過質(zhì)譜分析比較不同樣品中蛋白質(zhì)的相對含量。iTRAQ技術(shù)可以同時比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對含量,適用于研究不同病理?xiàng)l件下或不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異 。
TMT (Tandem Mass Tags):與iTRAQ類似,TMT也是一種體外標(biāo)記技術(shù),使用不同的同位素標(biāo)簽對肽段進(jìn)行標(biāo)記。TMT技術(shù)可以同時分析多達(dá)10個樣本,特別適合于比較不同處理方式或來自多個處理時間的樣本的差異蛋白分析 。
Label-Free Quantitation:這是一種非標(biāo)記定量策略,不依賴于同位素標(biāo)記,而是通過比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強(qiáng)度來對蛋白質(zhì)進(jìn)行相對定量。這種方法操作簡單,不需要昂貴的同位素標(biāo)簽,但對樣品制備和質(zhì)譜操作的質(zhì)量要求較高 。
SILAC (Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture):這是一種體內(nèi)標(biāo)記技術(shù),通過在細(xì)胞培養(yǎng)過程中使用穩(wěn)定同位素標(biāo)記的氨基酸,使得新合成的蛋白質(zhì)帶有同位素標(biāo)簽。SILAC技術(shù)可以用于比較不同細(xì)胞狀態(tài)下蛋白質(zhì)的表達(dá)水平 。
SWATH-MS (Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra):這是一種數(shù)據(jù)非依賴型采集模式的質(zhì)譜技術(shù),通過系統(tǒng)地掃描所有預(yù)定質(zhì)量窗口來收集質(zhì)譜數(shù)據(jù),提供高通量、高重復(fù)性的定量信息,適合復(fù)雜樣品分析 。
Proximity Labeling:這是一種研究蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù),通過將具有鄰近標(biāo)記功能的酶與目標(biāo)蛋白融合,將鄰近的蛋白標(biāo)記上生物素,然后通過親和素磁珠富集生物素標(biāo)記蛋白進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,分析目的蛋白的互作或鄰近的蛋白信息 。
MRM (Multiple Reaction Monitoring):這是一種高度選擇性和靈敏度的定量蛋白質(zhì)譜方法,通過檢測多個預(yù)定義的肽段來實(shí)現(xiàn)對特定蛋白質(zhì)的定量分析。MRM技術(shù)具有靈敏度和準(zhǔn)確性,能夠在復(fù)雜樣品中準(zhǔn)確測量目標(biāo)蛋白質(zhì)的濃度 。
這些技術(shù)各有優(yōu)勢和局限性,選擇合適的技術(shù)需要根據(jù)研究目的、樣品類型、實(shí)驗(yàn)條件和預(yù)算等因素綜合考慮。
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